2014-17年任中国人民银行研究局首席经济学家， [5]  该职位是央行首次设立。3年里，马骏的发声多次平息了市场不安，媒体称其为“央行在宏观经济研究领域对外发言人之一”。 [6]  任内，马骏牵头绿色金融研究小组提出发展绿色金融14条建议，主持起草七部委《关于构建绿色金融体系的指导意见》， [7]  推动在G20框架下形成发展绿色金融全球共识。 [8] 

2000-14年初在德意志银行任职，曾任德意志银行大中华区首席经济学家，兼任德意志银行董事总经理。 [9]  1992-2000年间在世界银行和国际货币基金组织工作，曾任经济学家和高级经济学家。1988-90年间为国务院发展研究中心研究人员。 [10]  任内，马骏四次被国际投资界权威的《机构投资者》杂志评为亚洲经济学家第一名、五次被该刊评为中国分析师第一名。 [11] 

2012年7月，国务院总理温家宝主持经济形势座谈会上的8位经济学家，马骏位列其中。2014年1月，国务院总理李克强在中南海召开主题为听取专家学者和企业界人士对《政府工作报告（征求意见稿）》意见和建议座谈会，马骏是唯一受邀外资机构研究人员。 [5]  2016年，马骏被第一财经评为“绿色金融领军人物” [12]  ；2017年，获《亚洲金融》“中国绿色金融发展杰出贡献奖”。 [13]  他的著作获中国银行业协会优秀成果一等奖 [14]  、金融图书“金羊奖” [15]  、中国金融40人论坛年度书籍荣誉。